Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATG9BQ674R7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG9BQ674R7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG9BQ674R7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG9BQ674R7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG9BQ674R7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms