Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM50Q3ZCQ8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMM50Q3ZCQ8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMM50Q3ZCQ8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMM50Q3ZCQ8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms