Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KRTAP21-3Q3LHN1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP21-3Q3LHN1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KRTAP21-3Q3LHN1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
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