Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SKOR2Q2VWA4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SKOR2Q2VWA4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKOR2Q2VWA4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms