Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms