Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VWC2Q2TAL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VWC2Q2TAL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VWC2Q2TAL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms