Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDK4Q16654 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDK4Q16654 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDK4Q16654 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDK4Q16654 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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