Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
VPS72Q15906 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
VPS72Q15906 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.79■■■■□ 3
VPS72Q15906 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
VPS72Q15906 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
VPS72Q15906 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
VPS72Q15906 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
VPS72Q15906 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
VPS72Q15906 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
VPS72Q15906 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
VPS72Q15906 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
VPS72Q15906 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
VPS72Q15906 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
VPS72Q15906 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
VPS72Q15906 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VPS72Q15906 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
VPS72Q15906 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms