Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SF3A2Q15428 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SF3A2Q15428 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SF3A2Q15428 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF3A2Q15428 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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