Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBA3CQ13748 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBA3CQ13748 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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