Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NAE1Q13564 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NAE1Q13564 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAE1Q13564 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAE1Q13564 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms