Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMED1Q13445 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMED1Q13445 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED1Q13445 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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