Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TMED1Q13445 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMED1Q13445 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
TMED1Q13445 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMED1Q13445 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMED1Q13445 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMED1Q13445 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMED1Q13445 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMED1Q13445 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TMED1Q13445 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TMED1Q13445 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMED1Q13445 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TMED1Q13445 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TMED1Q13445 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMED1Q13445 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMED1Q13445 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMED1Q13445 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMED1Q13445 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMED1Q13445 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMED1Q13445 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMED1Q13445 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMED1Q13445 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMED1Q13445 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMED1Q13445 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMED1Q13445 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMED1Q13445 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMED1Q13445 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMED1Q13445 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMED1Q13445 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMED1Q13445 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMED1Q13445 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMED1Q13445 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMED1Q13445 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMED1Q13445 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMED1Q13445 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMED1Q13445 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMED1Q13445 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMED1Q13445 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TMED1Q13445 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMED1Q13445 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMED1Q13445 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMED1Q13445 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMED1Q13445 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMED1Q13445 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMED1Q13445 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMED1Q13445 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMED1Q13445 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMED1Q13445 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMED1Q13445 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMED1Q13445 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMED1Q13445 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMED1Q13445 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMED1Q13445 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMED1Q13445 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMED1Q13445 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMED1Q13445 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMED1Q13445 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMED1Q13445 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMED1Q13445 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMED1Q13445 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMED1Q13445 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMED1Q13445 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMED1Q13445 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMED1Q13445 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMED1Q13445 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMED1Q13445 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMED1Q13445 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMED1Q13445 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMED1Q13445 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMED1Q13445 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMED1Q13445 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMED1Q13445 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMED1Q13445 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMED1Q13445 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMED1Q13445 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMED1Q13445 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMED1Q13445 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMED1Q13445 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMED1Q13445 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMED1Q13445 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMED1Q13445 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMED1Q13445 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMED1Q13445 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMED1Q13445 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMED1Q13445 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMED1Q13445 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMED1Q13445 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMED1Q13445 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED1Q13445 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED1Q13445 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMED1Q13445 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMED1Q13445 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMED1Q13445 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMED1Q13445 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMED1Q13445 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMED1Q13445 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMED1Q13445 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMED1Q13445 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMED1Q13445 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMED1Q13445 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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