Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC38A11Q08AI6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC38A11Q08AI6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SLC38A11Q08AI6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLC38A11Q08AI6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms