Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MC1RQ01726 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MC1RQ01726 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MC1RQ01726 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MC1RQ01726 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MC1RQ01726 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MC1RQ01726 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms