Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC5P78333 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC5P78333 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC5P78333 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC5P78333 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC5P78333 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC5P78333 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC5P78333 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC5P78333 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GPC5P78333 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC5P78333 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC5P78333 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC5P78333 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC5P78333 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC5P78333 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC5P78333 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC5P78333 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC5P78333 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC5P78333 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC5P78333 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC5P78333 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC5P78333 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC5P78333 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC5P78333 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC5P78333 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC5P78333 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC5P78333 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC5P78333 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC5P78333 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC5P78333 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GPC5P78333 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPC5P78333 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GPC5P78333 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GPC5P78333 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC5P78333 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC5P78333 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC5P78333 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC5P78333 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC5P78333 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC5P78333 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC5P78333 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC5P78333 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC5P78333 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC5P78333 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC5P78333 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC5P78333 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC5P78333 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC5P78333 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC5P78333 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC5P78333 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC5P78333 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC5P78333 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC5P78333 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC5P78333 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC5P78333 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC5P78333 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC5P78333 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC5P78333 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC5P78333 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC5P78333 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC5P78333 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC5P78333 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC5P78333 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC5P78333 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC5P78333 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC5P78333 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC5P78333 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC5P78333 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC5P78333 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC5P78333 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC5P78333 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC5P78333 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC5P78333 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC5P78333 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC5P78333 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC5P78333 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC5P78333 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC5P78333 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC5P78333 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC5P78333 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC5P78333 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC5P78333 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC5P78333 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC5P78333 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC5P78333 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC5P78333 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC5P78333 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC5P78333 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC5P78333 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC5P78333 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC5P78333 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC5P78333 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC5P78333 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC5P78333 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC5P78333 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC5P78333 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC5P78333 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC5P78333 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC5P78333 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPC5P78333 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms