Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNNC1P63316 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNNC1P63316 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNNC1P63316 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNNC1P63316 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms