Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC45.88■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC45.88■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC45.88■■■■■ 4.94
SMARCA4P51532 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.87■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC45.85■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC45.83■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
SMARCA4P51532 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC45.8■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC45.79■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC45.78■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC45.78■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC45.77■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC45.77■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.92
SMARCA4P51532 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC45.73■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.73■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC45.71■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.91
SMARCA4P51532 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.67■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC45.65■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC45.64■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC45.63■■■■■ 4.9
SMARCA4P51532 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC45.59■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.89
SMARCA4P51532 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.55■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
SMARCA4P51532 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms