Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GJA8P48165 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJA8P48165 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJA8P48165 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJA8P48165 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA8P48165 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA8P48165 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA8P48165 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJA8P48165 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA8P48165 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA8P48165 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA8P48165 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA8P48165 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA8P48165 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA8P48165 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJA8P48165 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA8P48165 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA8P48165 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA8P48165 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA8P48165 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA8P48165 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJA8P48165 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJA8P48165 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJA8P48165 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJA8P48165 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA8P48165 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA8P48165 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA8P48165 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA8P48165 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA8P48165 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA8P48165 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA8P48165 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA8P48165 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA8P48165 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJA8P48165 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA8P48165 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA8P48165 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA8P48165 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA8P48165 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJA8P48165 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJA8P48165 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJA8P48165 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJA8P48165 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJA8P48165 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJA8P48165 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA8P48165 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA8P48165 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA8P48165 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA8P48165 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJA8P48165 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GJA8P48165 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJA8P48165 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJA8P48165 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJA8P48165 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJA8P48165 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJA8P48165 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA8P48165 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA8P48165 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA8P48165 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA8P48165 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJA8P48165 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA8P48165 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA8P48165 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA8P48165 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA8P48165 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJA8P48165 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA8P48165 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA8P48165 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA8P48165 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA8P48165 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJA8P48165 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA8P48165 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA8P48165 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA8P48165 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GJA8P48165 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GJA8P48165 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJA8P48165 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJA8P48165 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GJA8P48165 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJA8P48165 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA8P48165 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA8P48165 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA8P48165 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA8P48165 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA8P48165 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA8P48165 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJA8P48165 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJA8P48165 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJA8P48165 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJA8P48165 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJA8P48165 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJA8P48165 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJA8P48165 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA8P48165 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA8P48165 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA8P48165 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA8P48165 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA8P48165 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJA8P48165 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GJA8P48165 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms