Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKX2-1P43699 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NKX2-1P43699 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NKX2-1P43699 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NKX2-1P43699 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms