Protein–RNA interactions for Protein: P39656

DDOST, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDOSTP39656 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDOSTP39656 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDOSTP39656 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDOSTP39656 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDOSTP39656 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDOSTP39656 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDOSTP39656 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDOSTP39656 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDOSTP39656 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDOSTP39656 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDOSTP39656 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDOSTP39656 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDOSTP39656 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DDOSTP39656 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDOSTP39656 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms