Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP5DP30049 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP5DP30049 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP5DP30049 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP5DP30049 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms