Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCHP24723 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCHP24723 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCHP24723 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKCHP24723 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCHP24723 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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