Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMA2P24043 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LAMA2P24043 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMA2P24043 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA2P24043 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms