Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMNB1P20700 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LMNB1P20700 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LMNB1P20700 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms