Protein–RNA interactions for Protein: P12956

XRCC6, X-ray repair cross-complementing protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6P12956 UBE3A-217ENST00000628890 424 ntTSL 34.22□□□□□ -1.733e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-216ENST00000628733 706 ntTSL 53.14□□□□□ -1.913e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-212ENST00000626589 394 ntTSL 53.09□□□□□ -1.913e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 CHD2-207ENST00000626782 2131 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 28.3
XRCC6P12956 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.782e-9■■■■■ 28.3
XRCC6P12956 AC013394.1-202ENST00000630790 4499 ntTSL 29.1□□□□□ -0.952e-9■■■■■ 28.3
XRCC6P12956 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.152e-9■■■■■ 28.3
XRCC6P12956 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.172e-9■■■■■ 28.3
XRCC6P12956 CHD2-221ENST00000635856 4236 ntTSL 57.74□□□□□ -1.172e-9■■■■■ 28.3
XRCC6P12956 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.172e-9■■■■■ 28.3
XRCC6P12956 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.513e-19■■■■■ 28.2
XRCC6P12956 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.463e-19■■■■■ 28.2
XRCC6P12956 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.33e-19■■■■■ 28.2
XRCC6P12956 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.182e-46■■■■■ 28.1
XRCC6P12956 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.314e-7■■■■■ 28
XRCC6P12956 MACF1-205ENST00000372925 14496 ntTSL 56.51□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 28
XRCC6P12956 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.494e-7■■■■■ 28
XRCC6P12956 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.574e-7■■■■■ 28
XRCC6P12956 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.714e-7■■■■■ 28
XRCC6P12956 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.774e-7■■■■■ 28
XRCC6P12956 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-8■■■■■ 28
XRCC6P12956 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.64■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 28
XRCC6P12956 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.062e-8■■■■■ 28
XRCC6P12956 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 28
XRCC6P12956 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 28
XRCC6P12956 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-8■■■■■ 28
XRCC6P12956 CTTN-205ENST00000415461 1021 ntTSL 322.38■■□□□ 1.175e-6■■■■■ 27.9
XRCC6P12956 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.875e-6■■■■■ 27.9
XRCC6P12956 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.395e-6■■■■■ 27.9
XRCC6P12956 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.335e-6■■■■■ 27.9
XRCC6P12956 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.033e-37■■■■■ 27.7
XRCC6P12956 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 411.09□□□□□ -0.633e-37■■■■■ 27.7
XRCC6P12956 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 411.09□□□□□ -0.633e-37■■■■■ 27.7
XRCC6P12956 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.693e-37■■■■■ 27.7
XRCC6P12956 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 410.28□□□□□ -0.763e-37■■■■■ 27.7
XRCC6P12956 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 29.57□□□□□ -0.883e-37■■■■■ 27.7
XRCC6P12956 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 29.49□□□□□ -0.893e-37■■■■■ 27.7
XRCC6P12956 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 48.31□□□□□ -1.083e-37■■■■■ 27.7
XRCC6P12956 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 48□□□□□ -1.133e-37■■■■■ 27.7
XRCC6P12956 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.284e-20■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.214e-20■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.734e-20■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 EZH2-209ENST00000492143 3641 ntTSL 221.57■■□□□ 1.044e-20■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.054e-20■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 EZH2-205ENST00000476773 2572 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.524e-20■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.934e-20■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-207ENST00000435198 1056 ntTSL 329.2■■■□□ 2.266e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.226e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-208ENST00000450390 2455 ntTSL 527.1■■□□□ 1.936e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 326.2■■□□□ 1.786e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.786e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ELAC2-218ENST00000584650 2087 ntTSL 225.75■■□□□ 1.716e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.666e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 PBX2-202ENST00000478678 1320 ntTSL 1 (best)24.66■■□□□ 1.546e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.526e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-209ENST00000461142 837 ntTSL 324.31■■□□□ 1.486e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ILKAP-209ENST00000490837 557 ntTSL 424.22■■□□□ 1.476e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 324.08■■□□□ 1.456e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.426e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.296e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.266e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-219ENST00000503294 814 ntTSL 422.91■■□□□ 1.266e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-206ENST00000422076 643 ntTSL 522.91■■□□□ 1.266e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.186e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ELAC2-207ENST00000480891 2737 ntTSL 222.34■■□□□ 1.176e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 CCDC88B-204ENST00000463837 5235 ntTSL 222.27■■□□□ 1.166e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 TCF3-206ENST00000585855 1170 ntTSL 322.27■■□□□ 1.166e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 TCF3-213ENST00000590436 1149 ntTSL 522.27■■□□□ 1.166e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.126e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.086e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ILKAP-204ENST00000463129 1861 ntTSL 221.6■■□□□ 1.056e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 TCF3-219ENST00000610756 1343 ntTSL 1 (best)21.56■■□□□ 1.046e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ILKAP-207ENST00000467133 618 ntTSL 421.53■■□□□ 1.046e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.026e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-220ENST00000509720 472 ntTSL 321.37■■□□□ 1.016e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 IFT172-206ENST00000450564 760 ntTSL 321.22■□□□□ 0.996e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ELAC2-205ENST00000465825 2793 ntTSL 221.06■□□□□ 0.966e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-211ENST00000466752 886 ntTSL 320.89■□□□□ 0.936e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-217ENST00000491779 611 ntTSL 220.89■□□□□ 0.936e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 PRKCA-203ENST00000578063 1733 ntTSL 1 (best)20.81■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.96e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.96e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ILKAP-203ENST00000457149 793 ntTSL 520.25■□□□□ 0.836e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ILKAP-210ENST00000498727 587 ntTSL 220.21■□□□□ 0.836e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.826e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 CCDC88B-209ENST00000494080 4563 ntTSL 219.78■□□□□ 0.766e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 IFT172-205ENST00000443889 690 ntTSL 219.71■□□□□ 0.756e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.746e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 TCF3-218ENST00000593064 2694 ntTSL 219.56■□□□□ 0.726e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 PBX2-205ENST00000496171 1050 ntTSL 219.09■□□□□ 0.656e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ELAC2-209ENST00000487229 2452 ntTSL 218.29■□□□□ 0.526e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 TCF3-215ENST00000590684 1313 ntTSL 317.98■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-218ENST00000502382 530 ntTSL 417.97■□□□□ 0.476e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.436e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 TCF3-214ENST00000590605 541 ntTSL 217.69■□□□□ 0.426e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 UBE2J2-215ENST00000477894 767 ntTSL 517.64■□□□□ 0.416e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 TCF3-217ENST00000592628 1751 ntTSL 517.49■□□□□ 0.396e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.386e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 ELAC2-208ENST00000484122 3738 ntTSL 216.99■□□□□ 0.316e-6■■■■■ 27.6
XRCC6P12956 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 216.97■□□□□ 0.316e-11■■■■■ 27.6
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