RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490837.1

ILKAP-209, Transcript of ILK associated serine/threonine phosphatase, humanhuman

TSL 4

Gene ILKAP, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILKAP-209ENST00000490837 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.68■■■■■ 6.18
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ILKAP-209ENST00000490837 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.29■■■■■ 4.84
ILKAP-209ENST00000490837 NACADO15069 1562 aa45.15■■■■■ 4.82
ILKAP-209ENST00000490837 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.99■■■■■ 4.79
ILKAP-209ENST00000490837 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.76■■■■■ 4.76
ILKAP-209ENST00000490837 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.62■■■■■ 4.73
ILKAP-209ENST00000490837 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.4■■■■■ 4.7
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ILKAP-209ENST00000490837 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.17■■■■■ 4.66
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ILKAP-209ENST00000490837 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.92■■■■■ 4.62
ILKAP-209ENST00000490837 SCRIBQ14160 1630 aa43.66■■■■■ 4.58
ILKAP-209ENST00000490837 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.48■■■■■ 4.55
ILKAP-209ENST00000490837 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
ILKAP-209ENST00000490837 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.77■■■■■ 4.44
ILKAP-209ENST00000490837 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.59■■■■■ 4.41
ILKAP-209ENST00000490837 SMARCA4P51532 1647 aa41.72■■■■■ 4.27
ILKAP-209ENST00000490837 NCAPD3P42695 1498 aa41.71■■■■■ 4.27
ILKAP-209ENST00000490837 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.65■■■■■ 4.26
ILKAP-209ENST00000490837 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
ILKAP-209ENST00000490837 SMARCA2P51531 1590 aa41.54■■■■■ 4.24
ILKAP-209ENST00000490837 HMGXB3Q12766 1538 aa41.43■■■■■ 4.22
ILKAP-209ENST00000490837 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.37■■■■■ 4.21
ILKAP-209ENST00000490837 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.34■■■■■ 4.21
ILKAP-209ENST00000490837 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
ILKAP-209ENST00000490837 WIZO95785 1651 aa40.85■■■■■ 4.13
ILKAP-209ENST00000490837 NESP48681 1621 aa40.83■■■■■ 4.13
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ILKAP-209ENST00000490837 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
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ILKAP-209ENST00000490837 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.46■■■■■ 4.07
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ILKAP-209ENST00000490837 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.26■■■■■ 4.04
ILKAP-209ENST00000490837 CFTRP13569 1480 aa40.13■■■■■ 4.01
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ILKAP-209ENST00000490837 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.96■■■■□ 3.99
ILKAP-209ENST00000490837 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.9■■■■□ 3.98
ILKAP-209ENST00000490837 WDR62O43379 1518 aa39.9■■■■□ 3.98
ILKAP-209ENST00000490837 PRDM2Q13029 1718 aa39.64■■■■□ 3.94
ILKAP-209ENST00000490837 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
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ILKAP-209ENST00000490837 TOPBP1Q92547 1522 aa39.29■■■■□ 3.88
ILKAP-209ENST00000490837 ABCC8Q09428 1581 aa39.24■■■■□ 3.87
ILKAP-209ENST00000490837 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.18■■■■□ 3.86
ILKAP-209ENST00000490837 IFT140Q96RY7 1462 aa39.16■■■■□ 3.86
ILKAP-209ENST00000490837 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
ILKAP-209ENST00000490837 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
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ILKAP-209ENST00000490837 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.76■■■■□ 3.8
ILKAP-209ENST00000490837 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.75■■■■□ 3.797e-7■■■■■ 31.6
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ILKAP-209ENST00000490837 WDR97A6NE52 1622 aa38.53■■■■□ 3.76
ILKAP-209ENST00000490837 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.4■■■■□ 3.74
ILKAP-209ENST00000490837 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.38■■■■□ 3.73
ILKAP-209ENST00000490837 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.38■■■■□ 3.73
ILKAP-209ENST00000490837 CHD1O14646 1710 aa38.37■■■■□ 3.73
ILKAP-209ENST00000490837 GRIN2BQ13224 1484 aa38.36■■■■□ 3.73
ILKAP-209ENST00000490837 TOP2BQ02880 1626 aa38.34■■■■□ 3.73
ILKAP-209ENST00000490837 FBLN2P98095 1184 aa38.34■■■■□ 3.73
ILKAP-209ENST00000490837 TRIM41Q8WV44 630 aa38.34■■■■□ 3.73
ILKAP-209ENST00000490837 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.33■■■■□ 3.73
ILKAP-209ENST00000490837 SYNJ1O43426 1573 aa38.32■■■■□ 3.73
ILKAP-209ENST00000490837 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
ILKAP-209ENST00000490837 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.3■■■■□ 3.72
ILKAP-209ENST00000490837 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.24■■■■□ 3.71
ILKAP-209ENST00000490837 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.21■■■■□ 3.71
ILKAP-209ENST00000490837 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.21■■■■□ 3.71
ILKAP-209ENST00000490837 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.21■■■■□ 3.71
ILKAP-209ENST00000490837 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
ILKAP-209ENST00000490837 ARHGEF11O15085 1522 aa38.17■■■■□ 3.7
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ILKAP-209ENST00000490837 PBRM1Q86U86 1689 aa38.17■■■■□ 3.7
ILKAP-209ENST00000490837 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.02■■■■□ 3.68
ILKAP-209ENST00000490837 ADAMTS12P58397 1594 aa37.91■■■■□ 3.66
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ILKAP-209ENST00000490837 ARAP1Q96P48 1450 aa37.86■■■■□ 3.65
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ILKAP-209ENST00000490837 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.85■■■■□ 3.65
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ILKAP-209ENST00000490837 IGF1RP08069 1367 aa37.57■■■■□ 3.61
ILKAP-209ENST00000490837 SHROOM2Q13796 1616 aa37.47■■■■□ 3.59
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ILKAP-209ENST00000490837 JPH4Q96JJ6 628 aa37.33■■■■□ 3.57
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