RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498727.5

ILKAP-210, Transcript of ILK associated serine/threonine phosphatase, humanhuman

TSL 2

Gene ILKAP, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILKAP-210ENST00000498727 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.68■■■■■ 5.06
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ILKAP-210ENST00000498727 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.2■■■■■ 4.35
ILKAP-210ENST00000498727 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.49■■■■■ 4.07
ILKAP-210ENST00000498727 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.47■■■■■ 4.07
ILKAP-210ENST00000498727 NACADO15069 1562 aa40.01■■■■■ 4
ILKAP-210ENST00000498727 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.79■■■■□ 3.96
ILKAP-210ENST00000498727 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.7■■■■□ 3.95
ILKAP-210ENST00000498727 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.51■■■■□ 3.91
ILKAP-210ENST00000498727 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.21■■■■□ 3.87
ILKAP-210ENST00000498727 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.2■■■■□ 3.87
ILKAP-210ENST00000498727 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.68■■■■□ 3.78
ILKAP-210ENST00000498727 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.58■■■■□ 3.77
ILKAP-210ENST00000498727 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.58■■■■□ 3.77
ILKAP-210ENST00000498727 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
ILKAP-210ENST00000498727 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.5■■■■□ 3.75
ILKAP-210ENST00000498727 SCRIBQ14160 1630 aa38.42■■■■□ 3.74
ILKAP-210ENST00000498727 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
ILKAP-210ENST00000498727 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.69■■■■□ 3.62
ILKAP-210ENST00000498727 CUX2O14529 1486 aa37.1■■■■□ 3.53
ILKAP-210ENST00000498727 ERCC6Q03468 1493 aa37.04■■■■□ 3.52
ILKAP-210ENST00000498727 NCAPD3P42695 1498 aa36.9■■■■□ 3.5
ILKAP-210ENST00000498727 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.7■■■■□ 3.47
ILKAP-210ENST00000498727 SMARCA2P51531 1590 aa36.65■■■■□ 3.46
ILKAP-210ENST00000498727 HMGXB3Q12766 1538 aa36.6■■■■□ 3.45
ILKAP-210ENST00000498727 SMARCA4P51532 1647 aa36.56■■■■□ 3.44
ILKAP-210ENST00000498727 NESP48681 1621 aa36.52■■■■□ 3.44
ILKAP-210ENST00000498727 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
ILKAP-210ENST00000498727 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.41
ILKAP-210ENST00000498727 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
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ILKAP-210ENST00000498727 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.16■■■■□ 3.38
ILKAP-210ENST00000498727 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.08■■■■□ 3.37
ILKAP-210ENST00000498727 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.06■■■■□ 3.36
ILKAP-210ENST00000498727 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.94■■■■□ 3.34
ILKAP-210ENST00000498727 TRIM41Q8WV44 630 aa35.92■■■■□ 3.34
ILKAP-210ENST00000498727 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.77■■■■□ 3.32
ILKAP-210ENST00000498727 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.76■■■■□ 3.32
ILKAP-210ENST00000498727 WDR62O43379 1518 aa35.66■■■■□ 3.3
ILKAP-210ENST00000498727 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.53■■■■□ 3.28
ILKAP-210ENST00000498727 WIZO95785 1651 aa35.52■■■■□ 3.28
ILKAP-210ENST00000498727 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.4■■■■□ 3.26
ILKAP-210ENST00000498727 OSCARQ8IYS5 282 aa35.33■■■■□ 3.25
ILKAP-210ENST00000498727 CFTRP13569 1480 aa35.22■■■■□ 3.23
ILKAP-210ENST00000498727 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
ILKAP-210ENST00000498727 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
ILKAP-210ENST00000498727 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
ILKAP-210ENST00000498727 PRDM2Q13029 1718 aa34.92■■■■□ 3.18
ILKAP-210ENST00000498727 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.92■■■■□ 3.18
ILKAP-210ENST00000498727 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.92■■■■□ 3.18
ILKAP-210ENST00000498727 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.92■■■■□ 3.18
ILKAP-210ENST00000498727 IFT140Q96RY7 1462 aa34.82■■■■□ 3.16
ILKAP-210ENST00000498727 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
ILKAP-210ENST00000498727 ARHGEF11O15085 1522 aa34.73■■■■□ 3.15
ILKAP-210ENST00000498727 TOPBP1Q92547 1522 aa34.65■■■■□ 3.14
ILKAP-210ENST00000498727 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.61■■■■□ 3.13
ILKAP-210ENST00000498727 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
ILKAP-210ENST00000498727 ABCC8Q09428 1581 aa34.59■■■■□ 3.13
ILKAP-210ENST00000498727 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.55■■■■□ 3.12
ILKAP-210ENST00000498727 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.49■■■■□ 3.11
ILKAP-210ENST00000498727 CHD1O14646 1710 aa34.47■■■■□ 3.11
ILKAP-210ENST00000498727 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
ILKAP-210ENST00000498727 FBLN2P98095 1184 aa34.41■■■■□ 3.1
ILKAP-210ENST00000498727 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.39■■■■□ 3.14e-7■■■■□ 24.6
ILKAP-210ENST00000498727 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
ILKAP-210ENST00000498727 ARAP1Q96P48 1450 aa34.33■■■■□ 3.09
ILKAP-210ENST00000498727 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
ILKAP-210ENST00000498727 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.13■■■■□ 3.05
ILKAP-210ENST00000498727 SOGA1O94964 1423 aa34.12■■■■□ 3.05
ILKAP-210ENST00000498727 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
ILKAP-210ENST00000498727 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.07■■■■□ 3.04
ILKAP-210ENST00000498727 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
ILKAP-210ENST00000498727 WDR97A6NE52 1622 aa34.03■■■■□ 3.04
ILKAP-210ENST00000498727 SYNJ1O43426 1573 aa34.02■■■■□ 3.04
ILKAP-210ENST00000498727 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.99■■■■□ 3.03
ILKAP-210ENST00000498727 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.97■■■■□ 3.03
ILKAP-210ENST00000498727 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
ILKAP-210ENST00000498727 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
ILKAP-210ENST00000498727 GRIN2BQ13224 1484 aa33.89■■■■□ 3.02
ILKAP-210ENST00000498727 SYNJ2O15056 1496 aa33.84■■■■□ 3.01
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ILKAP-210ENST00000498727 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.72■■■□□ 2.99
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ILKAP-210ENST00000498727 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.53■■■□□ 2.96
ILKAP-210ENST00000498727 GRIN2AQ12879 1464 aa33.44■■■□□ 2.94
ILKAP-210ENST00000498727 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.41■■■□□ 2.94
ILKAP-210ENST00000498727 CEP170Q5SW79 1584 aa33.36■■■□□ 2.93
ILKAP-210ENST00000498727 ADAMTS12P58397 1594 aa33.35■■■□□ 2.93
ILKAP-210ENST00000498727 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.33■■■□□ 2.93
ILKAP-210ENST00000498727 NUP160Q12769 1436 aa33.3■■■□□ 2.92
ILKAP-210ENST00000498727 SHROOM2Q13796 1616 aa33.24■■■□□ 2.91
ILKAP-210ENST00000498727 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.23■■■□□ 2.91
ILKAP-210ENST00000498727 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.15■■■□□ 2.9
ILKAP-210ENST00000498727 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.14■■■□□ 2.9
ILKAP-210ENST00000498727 TOP2BQ02880 1626 aa33.14■■■□□ 2.9
ILKAP-210ENST00000498727 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.12■■■□□ 2.89
ILKAP-210ENST00000498727 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
ILKAP-210ENST00000498727 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
ILKAP-210ENST00000498727 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.01■■■□□ 2.87
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