Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
POLA1P09884 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
POLA1P09884 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
POLA1P09884 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
POLA1P09884 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
POLA1P09884 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
POLA1P09884 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
POLA1P09884 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
POLA1P09884 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
POLA1P09884 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
POLA1P09884 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
POLA1P09884 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
POLA1P09884 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
POLA1P09884 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
POLA1P09884 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
POLA1P09884 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
POLA1P09884 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
POLA1P09884 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.41
POLA1P09884 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
POLA1P09884 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
POLA1P09884 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
POLA1P09884 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
POLA1P09884 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
POLA1P09884 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
POLA1P09884 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
POLA1P09884 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
POLA1P09884 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
POLA1P09884 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
POLA1P09884 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
POLA1P09884 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
POLA1P09884 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
POLA1P09884 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
POLA1P09884 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
POLA1P09884 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
POLA1P09884 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
POLA1P09884 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
POLA1P09884 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
POLA1P09884 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
POLA1P09884 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
POLA1P09884 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
POLA1P09884 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
POLA1P09884 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
POLA1P09884 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
POLA1P09884 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
POLA1P09884 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
POLA1P09884 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC42.54■■■■■ 4.4
POLA1P09884 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
POLA1P09884 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
POLA1P09884 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
POLA1P09884 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
POLA1P09884 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
POLA1P09884 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
POLA1P09884 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
POLA1P09884 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
POLA1P09884 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
POLA1P09884 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
POLA1P09884 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
POLA1P09884 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
POLA1P09884 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
POLA1P09884 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
POLA1P09884 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
POLA1P09884 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
POLA1P09884 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
POLA1P09884 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
POLA1P09884 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
POLA1P09884 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
POLA1P09884 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
POLA1P09884 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
POLA1P09884 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
POLA1P09884 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
POLA1P09884 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
POLA1P09884 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
POLA1P09884 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
POLA1P09884 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
POLA1P09884 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
POLA1P09884 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
POLA1P09884 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
POLA1P09884 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
POLA1P09884 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
POLA1P09884 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
POLA1P09884 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
POLA1P09884 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
POLA1P09884 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
POLA1P09884 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
POLA1P09884 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
POLA1P09884 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
POLA1P09884 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
POLA1P09884 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
POLA1P09884 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
POLA1P09884 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
POLA1P09884 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
POLA1P09884 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
POLA1P09884 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
POLA1P09884 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
POLA1P09884 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
POLA1P09884 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
POLA1P09884 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
POLA1P09884 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
POLA1P09884 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
POLA1P09884 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms