Protein–RNA interactions for Protein: P06239

LCK, Tyrosine-protein kinase Lck, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCKP06239 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCKP06239 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCKP06239 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LCKP06239 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LCKP06239 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCKP06239 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCKP06239 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCKP06239 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCKP06239 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCKP06239 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCKP06239 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCKP06239 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCKP06239 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCKP06239 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCKP06239 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCKP06239 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCKP06239 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LCKP06239 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCKP06239 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCKP06239 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCKP06239 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCKP06239 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCKP06239 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCKP06239 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCKP06239 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCKP06239 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCKP06239 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCKP06239 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCKP06239 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCKP06239 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCKP06239 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCKP06239 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCKP06239 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCKP06239 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCKP06239 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCKP06239 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCKP06239 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCKP06239 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCKP06239 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCKP06239 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCKP06239 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCKP06239 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCKP06239 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCKP06239 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCKP06239 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCKP06239 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LCKP06239 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCKP06239 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCKP06239 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCKP06239 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCKP06239 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCKP06239 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCKP06239 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCKP06239 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCKP06239 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCKP06239 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCKP06239 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCKP06239 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCKP06239 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCKP06239 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCKP06239 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCKP06239 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCKP06239 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LCKP06239 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCKP06239 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCKP06239 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCKP06239 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCKP06239 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCKP06239 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCKP06239 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCKP06239 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCKP06239 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCKP06239 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCKP06239 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCKP06239 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCKP06239 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCKP06239 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCKP06239 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCKP06239 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LCKP06239 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCKP06239 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCKP06239 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCKP06239 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCKP06239 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCKP06239 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCKP06239 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCKP06239 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCKP06239 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCKP06239 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCKP06239 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCKP06239 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCKP06239 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCKP06239 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCKP06239 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCKP06239 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCKP06239 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCKP06239 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCKP06239 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCKP06239 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCKP06239 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms