Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
NPHP4O75161 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NPHP4O75161 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NPHP4O75161 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
NPHP4O75161 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NPHP4O75161 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NPHP4O75161 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NPHP4O75161 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NPHP4O75161 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NPHP4O75161 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NPHP4O75161 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NPHP4O75161 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NPHP4O75161 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NPHP4O75161 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NPHP4O75161 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms