Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRID2O43424 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GRID2O43424 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GRID2O43424 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRID2O43424 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRID2O43424 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRID2O43424 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRID2O43424 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRID2O43424 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRID2O43424 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRID2O43424 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRID2O43424 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRID2O43424 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRID2O43424 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRID2O43424 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRID2O43424 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRID2O43424 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRID2O43424 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRID2O43424 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID2O43424 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID2O43424 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID2O43424 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID2O43424 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID2O43424 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID2O43424 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID2O43424 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID2O43424 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID2O43424 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID2O43424 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRID2O43424 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
GRID2O43424 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRID2O43424 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRID2O43424 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRID2O43424 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID2O43424 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID2O43424 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID2O43424 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID2O43424 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID2O43424 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID2O43424 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRID2O43424 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRID2O43424 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRID2O43424 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRID2O43424 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRID2O43424 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRID2O43424 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRID2O43424 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRID2O43424 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRID2O43424 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRID2O43424 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRID2O43424 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRID2O43424 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRID2O43424 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRID2O43424 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GRID2O43424 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRID2O43424 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GRID2O43424 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GRID2O43424 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GRID2O43424 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
GRID2O43424 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRID2O43424 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRID2O43424 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GRID2O43424 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRID2O43424 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRID2O43424 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GRID2O43424 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRID2O43424 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRID2O43424 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRID2O43424 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRID2O43424 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRID2O43424 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRID2O43424 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRID2O43424 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GRID2O43424 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRID2O43424 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRID2O43424 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRID2O43424 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GRID2O43424 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRID2O43424 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GRID2O43424 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRID2O43424 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRID2O43424 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRID2O43424 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRID2O43424 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRID2O43424 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRID2O43424 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRID2O43424 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRID2O43424 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRID2O43424 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRID2O43424 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRID2O43424 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRID2O43424 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRID2O43424 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRID2O43424 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRID2O43424 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRID2O43424 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRID2O43424 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRID2O43424 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRID2O43424 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRID2O43424 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms