Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SYNJ2O15056 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
SYNJ2O15056 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SYNJ2O15056 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
SYNJ2O15056 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
SYNJ2O15056 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
SYNJ2O15056 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SYNJ2O15056 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SYNJ2O15056 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
SYNJ2O15056 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC41.67■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
SYNJ2O15056 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
SYNJ2O15056 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
SYNJ2O15056 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
SYNJ2O15056 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SYNJ2O15056 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms