Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0J9YXV3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
A0A0J9YXV3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A0A0J9YXV3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms