Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CIZ1-212ENST00000471773 717 ntTSL 28.68□□□□□ -1.023e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 WNK2-206ENST00000448039 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.47■■□□□ 1.195e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 AP2A1-208ENST00000601356 2238 nt24.08■■□□□ 1.452e-10■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 UPF1-210ENST00000600689 3084 ntTSL 218.11■□□□□ 0.492e-10■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 REXO1-207ENST00000590936 1271 ntTSL 516.74■□□□□ 0.272e-10■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 UPF1-204ENST00000596842 3825 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-10■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 REXO1-204ENST00000587404 279 ntTSL 214.58□□□□□ -0.082e-10■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 PLXNB1-206ENST00000462738 663 ntTSL 222.66■■□□□ 1.222e-14■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 PLXNB1-217ENST00000484485 560 ntTSL 420.14■□□□□ 0.812e-14■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 LAMB2-210ENST00000483057 558 ntTSL 216.81■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 LAMB2-203ENST00000462930 536 ntTSL 216.38■□□□□ 0.212e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 LAMB2-204ENST00000464891 732 ntTSL 415.51■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 LAMB2-213ENST00000486298 590 ntTSL 415.43■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.397e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 MAGED1-209ENST00000485420 2906 ntTSL 512.42□□□□□ -0.427e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 MAGED1-203ENST00000375722 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.467e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 MAGED1-202ENST00000375695 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.57e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 MAGED1-204ENST00000375772 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.757e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 MAGED1-210ENST00000494718 5418 ntTSL 210.24□□□□□ -0.777e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 TLN1-203ENST00000464379 814 ntTSL 314.81□□□□□ -0.049e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 DGCR8-206ENST00000485802 555 ntTSL 515.54■□□□□ 0.085e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.374e-8■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.124e-8■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 HLF-204ENST00000572002 1251 ntTSL 314.06□□□□□ -0.164e-8■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 HLF-203ENST00000570962 1310 ntTSL 212.61□□□□□ -0.394e-8■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 HLF-208ENST00000573945 2977 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.884e-8■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.244e-8■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 C19orf54-205ENST00000596809 1104 ntTSL 523.96■■□□□ 1.435e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.515e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 C19orf54-207ENST00000597507 947 ntTSL 218.19■□□□□ 0.55e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 C19orf54-202ENST00000469741 1792 ntTSL 216.72■□□□□ 0.275e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.135e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 C19orf54-209ENST00000598485 553 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.425e-6■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 SERPINA5-203ENST00000553780 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.494e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 SERPINA5-211ENST00000556730 1463 ntTSL 211.34□□□□□ -0.594e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 SERPINA5-208ENST00000554866 2211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.644e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 SERPINA5-205ENST00000554276 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.664e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 SERPINA5-201ENST00000329597 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.734e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.551e-12■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.381e-12■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.025e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.215e-7■■□□□ 11.5
PCBP1Q15365 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.035e-6■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.66e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.096e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CNN2-206ENST00000564572 2266 nt15.5■□□□□ 0.076e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.066e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 MT2A-204ENST00000563985 688 ntTSL 215.33■□□□□ 0.046e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CCAR2-211ENST00000522599 1107 ntTSL 515.26■□□□□ 0.036e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.016e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 MT2A-203ENST00000562017 903 nt14.98□□□□□ -0.016e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.036e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.036e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.056e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 MT2A-205ENST00000567300 416 ntTSL 214.61□□□□□ -0.076e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.186e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.366e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.486e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 ELF4-204ENST00000615377 3878 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.956e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.956e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CCAR2-207ENST00000521020 614 ntTSL 38.32□□□□□ -1.086e-12■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CSNK2B-205ENST00000465481 579 ntTSL 1 (best)16.22■□□□□ 0.194e-24■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CSNK2B-207ENST00000475875 590 ntTSL 1 (best)16.22■□□□□ 0.194e-24■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CSNK2B-208ENST00000481269 785 ntTSL 212.4□□□□□ -0.424e-24■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.095e-38■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 SDF4-204ENST00000459994 604 ntTSL 517.08■□□□□ 0.321e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 FUS-212ENST00000569760 639 ntTSL 226.01■■□□□ 1.754e-6■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 FUS-204ENST00000483853 778 ntTSL 223.53■■□□□ 1.364e-6■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 SURF4-204ENST00000465565 400 ntTSL 322.02■■□□□ 1.124e-6■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 SURF4-205ENST00000467910 693 ntTSL 514.56□□□□□ -0.084e-6■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.584e-6■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 COL27A1-204ENST00000477421 3991 ntTSL 211.14□□□□□ -0.634e-6■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 TTLL3-202ENST00000383827 4834 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-7■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 TTLL3-225ENST00000473661 3811 ntTSL 511.38□□□□□ -0.592e-7■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.953e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.673e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.63e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.353e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.83e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 MT1X-204ENST00000568370 1727 nt17.84■□□□□ 0.453e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 GSE1-209ENST00000479488 649 ntTSL 217.05■□□□□ 0.323e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.13e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.113e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.113e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.163e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 MT1X-201ENST00000394485 450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.783e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 MT1X-203ENST00000564974 549 ntTSL 1 (best)9.79□□□□□ -0.843e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.526e-13■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.646e-13■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 ARF1-201ENST00000272102 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.526e-13■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 TTYH3-205ENST00000429448 756 ntTSL 211.37□□□□□ -0.594e-8■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.645e-7■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.525e-7■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 TNRC18-201ENST00000328270 1220 ntTSL 523.98■■□□□ 1.436e-7■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.081e-14■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.91e-14■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 ACADVL-237ENST00000583858 1015 ntTSL 520.49■□□□□ 0.871e-14■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 ACADVL-201ENST00000322910 2352 ntTSL 220.08■□□□□ 0.811e-14■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 ACADVL-209ENST00000578033 562 ntTSL 219.56■□□□□ 0.721e-14■■□□□ 11.4
PCBP1Q15365 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.711e-14■■□□□ 11.4
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