Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LMO4P61968 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LMO4P61968 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms