Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms