Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 RNF216-201ENST00000389900 3104 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 DNM2-215ENST00000590806 5651 ntTSL 214.22□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.723e-8■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.027e-7■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SMAD3-204ENST00000540846 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SMAD3-205ENST00000558428 554 ntTSL 411.75□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SMAD3-208ENST00000558827 552 ntTSL 411.66□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SMAD3-202ENST00000439724 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SMAD3-203ENST00000537194 1147 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 SMAD3-209ENST00000558894 797 ntTSL 55.13□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 27.4
PCBP2Q15366 CARHSP1-215ENST00000570125 681 ntTSL 426.7■■□□□ 1.864e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 CARHSP1-204ENST00000562586 578 ntTSL 214.92□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 CARHSP1-210ENST00000567908 565 ntTSL 212.87□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.597e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 FAM83H-202ENST00000395103 3611 ntTSL 215.77■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.21e-8■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.041e-8■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.25e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 SNX10-206ENST00000416246 823 ntTSL 27.43□□□□□ -1.225e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 SNX10-205ENST00000412416 429 ntTSL 35.71□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.575e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 MXD3-206ENST00000503782 1854 ntTSL 227.57■■■□□ 22e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.742e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 MXD3-205ENST00000503473 2279 ntTSL 525.38■■□□□ 1.652e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TTC31-207ENST00000459957 873 ntTSL 219.16■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 MXD3-204ENST00000502529 440 ntTSL 319.01■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 MXD3-209ENST00000513169 555 ntTSL 515.91■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TTC31-210ENST00000464241 1562 ntTSL 1 (best)15.52■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TTC31-208ENST00000463189 894 ntTSL 314.88□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TTC31-206ENST00000449459 2161 ntTSL 213.47□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TTC31-201ENST00000233623 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TTC31-213ENST00000491252 3860 ntTSL 29.94□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TTC31-204ENST00000424122 2806 ntTSL 1 (best)9.86□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TTC31-202ENST00000410003 3358 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TTC31-212ENST00000489152 4025 ntTSL 29.29□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.074e-19■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.784e-19■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-21■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 01e-6■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-9■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 RNF41-201ENST00000345093 5596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.371e-8■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TAF10-202ENST00000527248 425 ntTSL 317.7■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 TAF10-205ENST00000616342 5392 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 27.3
PCBP2Q15366 AGRN-205ENST00000469403 899 ntTSL 325.53■■□□□ 1.681e-6■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 AGRN-206ENST00000477585 707 ntTSL 322.94■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.181e-13■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.431e-13■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.431e-13■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-13■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 RAB3GAP2-203ENST00000462353 1906 ntTSL 1 (best)9.27□□□□□ -0.935e-8■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 RAB3GAP2-206ENST00000475769 375 ntTSL 38.25□□□□□ -1.095e-8■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 317.16■□□□□ 0.347e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 413.19□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 SPATS2L-210ENST00000421573 600 ntTSL 510.87□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 SPATS2L-213ENST00000438761 887 ntTSL 57.4□□□□□ -1.223e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 SPATS2L-217ENST00000449647 678 ntTSL 56.66□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.136e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 CUL5-205ENST00000532064 1109 ntTSL 516.79■□□□□ 0.287e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 CUL5-202ENST00000526303 751 ntTSL 211.95□□□□□ -0.57e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 UBE2L3-203ENST00000496722 3451 ntTSL 213.84□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 UBE2L3-202ENST00000458578 3007 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 PCF11-203ENST00000530304 2649 ntTSL 1 (best)19.19■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 PCF11-207ENST00000624931 1720 nt17.13■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 PCF11-206ENST00000533018 580 ntTSL 316.43■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 PCF11-204ENST00000530660 3309 ntTSL 213.39□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 STAG2-216ENST00000471107 709 ntTSL 56.32□□□□□ -1.43e-10■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 STAG2-208ENST00000428941 678 ntTSL 35.62□□□□□ -1.513e-10■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 STAG2-214ENST00000466748 873 ntTSL 55.42□□□□□ -1.543e-10■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 STAG2-210ENST00000435215 798 ntTSL 55.37□□□□□ -1.553e-10■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 STAG2-207ENST00000394478 676 ntTSL 54.86□□□□□ -1.633e-10■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.593e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 PDE4D-212ENST00000505453 1430 ntTSL 510.13□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.343e-8■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 HMGA2-208ENST00000537429 1527 ntTSL 1 (best)23.44■■□□□ 1.343e-8■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.173e-8■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.953e-8■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 SEPT9-241ENST00000591934 553 ntTSL 415.8■□□□□ 0.127e-7■■■■■ 27.2
PCBP2Q15366 SEPT9-231ENST00000590595 569 ntTSL 315.08■□□□□ 07e-7■■■■■ 27.2
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