Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPASTQ9UBP0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms