Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM52Q96A61 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms