Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NME5P56597 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
NME5P56597 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NME5P56597 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NME5P56597 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NME5P56597 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms