Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GOLGA8SH3BPF8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GOLGA8SH3BPF8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms