Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 NOS1AP-202ENST00000430120 1732 ntTSL 1 (best)16.78■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.266e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 IL17RC-217ENST00000464406 807 ntTSL 216.62■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.246e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 C19orf70-202ENST00000585605 586 ntTSL 316.53■□□□□ 0.246e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ERBB2-222ENST00000584908 1316 ntTSL 1 (best)16.37■□□□□ 0.216e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 NELFCD-211ENST00000492016 606 ntTSL 216.08■□□□□ 0.166e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 IL17RC-207ENST00000424206 949 ntTSL 316.08■□□□□ 0.166e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 NELFCD-203ENST00000471621 902 ntTSL 216.08■□□□□ 0.166e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 AL133352.1-202ENST00000527595 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.08■□□□□ 0.166e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.166e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.156e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.156e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 215.91■□□□□ 0.146e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.136e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 METAP1-205ENST00000507537 718 ntTSL 315.75■□□□□ 0.116e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.16e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 USP35-206ENST00000530535 2125 ntTSL 215.58■□□□□ 0.086e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 AL133352.1-201ENST00000529568 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.48■□□□□ 0.076e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.066e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 NDUFB8-205ENST00000466088 829 ntTSL 215.42■□□□□ 0.066e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.056e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.056e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 NDUFB8-206ENST00000528425 608 ntTSL 415.29■□□□□ 0.046e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 DQX1-205ENST00000473508 2136 ntTSL 215.23■□□□□ 0.036e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.036e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 UCKL1-207ENST00000632800 1530 ntTSL 515.01□□□□□ -0.016e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.056e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ARL6IP1-208ENST00000569976 778 ntTSL 214.73□□□□□ -0.056e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.086e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-210ENST00000430525 524 ntTSL 414.35□□□□□ -0.116e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 PPARA-205ENST00000420804 572 ntTSL 214.26□□□□□ -0.136e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.146e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.156e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.26e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.226e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.226e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-204ENST00000424161 556 ntTSL 413.66□□□□□ -0.226e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.236e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.246e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.246e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 KDM4C-206ENST00000438023 4022 ntTSL 513.42□□□□□ -0.266e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.276e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 IL17RC-223ENST00000478206 597 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.276e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.276e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-211ENST00000430853 564 ntTSL 413.36□□□□□ -0.276e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ERGIC3-209ENST00000447986 1632 ntTSL 1 (best)13.25□□□□□ -0.296e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ERBB2-217ENST00000584099 583 ntTSL 412.93□□□□□ -0.346e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.346e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-217ENST00000452612 746 ntTSL 312.91□□□□□ -0.346e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.386e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-203ENST00000419253 846 ntTSL 1 (best)12.52□□□□□ -0.416e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 AL133352.1-205ENST00000533549 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 412.51□□□□□ -0.416e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ERGIC3-205ENST00000413587 977 ntTSL 512.34□□□□□ -0.436e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.446e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.446e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 METAP1-210ENST00000513199 613 ntTSL 512.31□□□□□ -0.446e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.486e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ERGIC3-220ENST00000640748 832 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.496e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 STRIP1-205ENST00000485775 3363 ntTSL 1 (best)11.48□□□□□ -0.576e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 SECISBP2-209ENST00000534113 3584 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.586e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-218ENST00000453632 562 ntTSL 411.41□□□□□ -0.586e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 STRIP1-201ENST00000369795 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.586e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ERGIC3-206ENST00000416206 1235 ntTSL 511.39□□□□□ -0.596e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 CUL4A-201ENST00000326335 3705 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.666e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 PGM1-201ENST00000371083 2657 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.76e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 DQX1-203ENST00000418139 1688 ntTSL 510.63□□□□□ -0.716e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ERGIC3-219ENST00000496172 781 ntTSL 210.51□□□□□ -0.736e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TMEM68-215ENST00000523180 510 ntTSL 210.48□□□□□ -0.736e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 KDM4C-201ENST00000381306 4601 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.736e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.756e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-205ENST00000425112 807 ntTSL 310.21□□□□□ -0.776e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 DQX1-206ENST00000483555 832 ntTSL 310.19□□□□□ -0.786e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 METAP1-202ENST00000503247 653 ntTSL 510.19□□□□□ -0.786e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 STRIP1-204ENST00000473429 4870 ntTSL 210.08□□□□□ -0.86e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 STRIP1-202ENST00000369796 3125 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.86e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 AL133352.1-204ENST00000528174 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 39.86□□□□□ -0.836e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 PPARA-210ENST00000493286 1564 ntTSL 1 (best)9.67□□□□□ -0.866e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 STRIP1-208ENST00000539541 694 ntTSL 29.63□□□□□ -0.876e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-214ENST00000435348 578 ntTSL 49.52□□□□□ -0.896e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-208ENST00000428818 706 ntTSL 59.5□□□□□ -0.896e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-215ENST00000436996 662 ntTSL 29.5□□□□□ -0.896e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 KDM4C-202ENST00000381309 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.896e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 COPG1-210ENST00000515725 3231 ntTSL 29.33□□□□□ -0.926e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ERGIC3-214ENST00000482338 598 ntTSL 28.97□□□□□ -0.976e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TMEM68-201ENST00000334667 2401 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.986e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 DDB1-213ENST00000539332 1767 ntTSL 28.95□□□□□ -0.986e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 STRIP1-207ENST00000535003 810 ntTSL 38.88□□□□□ -0.996e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ERGIC3-218ENST00000489071 582 ntTSL 28.64□□□□□ -1.036e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 COPG1-201ENST00000314797 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.046e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 SECISBP2-205ENST00000470305 5405 ntTSL 1 (best)8.47□□□□□ -1.056e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-209ENST00000428858 565 ntTSL 48.28□□□□□ -1.086e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-216ENST00000437713 854 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.16e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.116e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 PON2-211ENST00000483292 699 ntTSL 38.1□□□□□ -1.116e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.126e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 TTC28-AS1-220ENST00000454996 837 ntTSL 27.64□□□□□ -1.196e-7■■■■□ 20.6
RBM22Q9NW64 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.196e-7■■■■□ 20.6
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