RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NISCHQ9Y2I1 1504 aa19.5■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.2■□□□□ 0.34
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABCC9O60706 1549 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NACADO15069 1562 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCRIBQ14160 1630 aa15.69■□□□□ 0.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.61■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.6■□□□□ 0.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.55■□□□□ 0.08
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.1■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMARCA4P51532 1647 aa15.05■□□□□ -0
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.03■□□□□ -0
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.02□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NCAPD3P42695 1498 aa14.95□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMARCA2P51531 1590 aa14.94□□□□□ -0.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HMGXB3Q12766 1538 aa14.87□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WIZO95785 1651 aa14.81□□□□□ -0.04
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.51□□□□□ -0.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CFTRP13569 1480 aa14.47□□□□□ -0.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.47□□□□□ -0.09
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NESP48681 1621 aa14.45□□□□□ -0.1
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.39□□□□□ -0.11
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ERCC6Q03468 1493 aa14.32□□□□□ -0.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.31□□□□□ -0.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.27□□□□□ -0.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.22□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.21□□□□□ -0.13
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRDM2Q13029 1718 aa14.21□□□□□ -0.14
TTC28-AS1-209ENST00000428858 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WDR62O43379 1518 aa14.17□□□□□ -0.14
TTC28-AS1-209ENST00000428858 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABCC8Q09428 1581 aa14.13□□□□□ -0.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CUX2O14529 1486 aa14.13□□□□□ -0.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TOPBP1Q92547 1522 aa14.1□□□□□ -0.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.1□□□□□ -0.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.08□□□□□ -0.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CUX1P39880 1505 aa14.07□□□□□ -0.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYNJ1O43426 1573 aa14□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TOP2BQ02880 1626 aa14□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IFT140Q96RY7 1462 aa13.99□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.97□□□□□ -0.17
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SOGA1O94964 1423 aa13.95□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.93□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.9□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM41Q8WV44 630 aa13.87□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WDR97A6NE52 1622 aa13.85□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.83□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GAPVD1Q14C86 1478 aa13.8□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa13.79□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KIF27Q86VH2 1401 aa13.78□□□□□ -0.2
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GRIN2BQ13224 1484 aa13.77□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.73□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.71□□□□□ -0.21
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGF1RP08069 1367 aa13.71□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FHAD1B1AJZ9 1412 aa13.67□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EEA1Q15075 1411 aa13.67□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.67□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYNJ2O15056 1496 aa13.67□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PBRM1Q86U86 1689 aa13.65□□□□□ -0.22
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADAMTS12P58397 1594 aa13.64□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa13.61□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.6□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CUL7Q14999 1698 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GRIN2AQ12879 1464 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRXQ9BXM0 1461 aa13.59□□□□□ -0.23
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBLN2P98095 1184 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OSCARQ8IYS5 282 aa13.58□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NUP160Q12769 1436 aa13.56□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa13.55□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CHD1O14646 1710 aa13.52□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.49□□□□□ -0.25
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CEP170Q5SW79 1584 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.6 ms