RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430853.5

TTC28-AS1-211, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 564 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.19■■■□□ 2.58
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.62■■■□□ 2.01
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ABCC9O60706 1549 aa26.51■■□□□ 1.83
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.9■■□□□ 1.74
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.88■■□□□ 1.73
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NACADO15069 1562 aa25.86■■□□□ 1.73
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.82■■□□□ 1.72
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.78■■□□□ 1.72
TTC28-AS1-211ENST00000430853 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.17■■□□□ 1.62
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SCRIBQ14160 1630 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC28-AS1-211ENST00000430853 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.93■■□□□ 1.58
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.82■■□□□ 1.56
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.21■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.19■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SMARCA4P51532 1647 aa24.12■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.05■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MROH2BQ7Z745 1585 aa24■■□□□ 1.43
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SMARCA2P51531 1590 aa23.92■■□□□ 1.42
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.92■■□□□ 1.42
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.87■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NCAPD3P42695 1498 aa23.84■■□□□ 1.41
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WIZO95785 1651 aa23.78■■□□□ 1.4
TTC28-AS1-211ENST00000430853 HMGXB3Q12766 1538 aa23.76■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-211ENST00000430853 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.28■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-211ENST00000430853 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.16■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.14■■□□□ 1.3
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CFTRP13569 1480 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NESP48681 1621 aa23.05■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PRDM2Q13029 1718 aa23.01■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.99■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ERCC6Q03468 1493 aa22.86■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.86■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.84■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.81■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.69■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-211ENST00000430853 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ABCC8Q09428 1581 aa22.65■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WDR62O43379 1518 aa22.62■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-211ENST00000430853 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.58■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TOPBP1Q92547 1522 aa22.54■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CUX2O14529 1486 aa22.53■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CUX1P39880 1505 aa22.51■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TOP2BQ02880 1626 aa22.46■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-211ENST00000430853 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.46■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SYNJ1O43426 1573 aa22.42■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-211ENST00000430853 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.37■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-211ENST00000430853 IFT140Q96RY7 1462 aa22.33■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SOGA1O94964 1423 aa22.3■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TRIM41Q8WV44 630 aa22.27■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.23■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-211ENST00000430853 WDR97A6NE52 1622 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.08■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-211ENST00000430853 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-211ENST00000430853 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KIF27Q86VH2 1401 aa22.06■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GRIN2BQ13224 1484 aa22.01■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PBRM1Q86U86 1689 aa21.99■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.97■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-211ENST00000430853 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.96■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-211ENST00000430853 EEA1Q15075 1411 aa21.95■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-211ENST00000430853 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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TTC28-AS1-211ENST00000430853 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.88■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.88■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CUL7Q14999 1698 aa21.86■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.83■■□□□ 1.09
TTC28-AS1-211ENST00000430853 ADAMTS12P58397 1594 aa21.82■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-211ENST00000430853 SYNJ2O15056 1496 aa21.82■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.79■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.77■■□□□ 1.08
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CHD1O14646 1710 aa21.75■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GRIN2AQ12879 1464 aa21.71■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-211ENST00000430853 PRXQ9BXM0 1461 aa21.71■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FBLN2P98095 1184 aa21.71■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-211ENST00000430853 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-211ENST00000430853 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.71■■□□□ 1.07
TTC28-AS1-211ENST00000430853 OSCARQ8IYS5 282 aa21.65■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-211ENST00000430853 KIF21BO75037 1637 aa21.65■■□□□ 1.06
TTC28-AS1-211ENST00000430853 NUP160Q12769 1436 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CEP170Q5SW79 1584 aa21.56■■□□□ 1.04
TTC28-AS1-211ENST00000430853 GOLGA3Q08378 1498 aa21.53■■□□□ 1.04
TTC28-AS1-211ENST00000430853 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.53■■□□□ 1.04
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