Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTR2AP28223 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTR2AP28223 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms