Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.359e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-215ENST00000521299 868 ntTSL 512.85□□□□□ -0.359e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.359e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.352e-11■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.362e-11■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 COPS7B-202ENST00000357490 563 ntTSL 412.81□□□□□ -0.363e-12■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ATG7-214ENST00000451513 972 ntTSL 312.79□□□□□ -0.369e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 COPS7B-222ENST00000492423 689 ntTSL 212.61□□□□□ -0.393e-12■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.49e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RPRD1A-211ENST00000592674 566 ntTSL 412.56□□□□□ -0.49e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RPRD1A-208ENST00000589050 1022 ntTSL 1 (best)12.56□□□□□ -0.49e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DHTKD1-203ENST00000437298 933 ntTSL 312.42□□□□□ -0.429e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.429e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ABCA2-204ENST00000398207 876 ntTSL 512.39□□□□□ -0.432e-11■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.439e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.437e-8■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.449e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DBF4B-209ENST00000531699 624 ntTSL 412.25□□□□□ -0.459e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.486e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DBF4B-210ENST00000532789 933 ntTSL 211.94□□□□□ -0.59e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SPECC1-216ENST00000581973 674 ntTSL 511.89□□□□□ -0.519e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NCALD-214ENST00000520425 580 ntTSL 411.87□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RNF4-210ENST00000508235 603 ntTSL 311.86□□□□□ -0.519e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.519e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.512e-11■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.529e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.539e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-207ENST00000519208 662 ntTSL 411.75□□□□□ -0.539e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.539e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.541e-12■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-219ENST00000522663 2879 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.549e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NCALD-207ENST00000518166 570 ntTSL 211.64□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.556e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 UBAP2-202ENST00000379225 1809 ntTSL 211.6□□□□□ -0.559e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.569e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ABCA2-224ENST00000625103 371 ntTSL 311.35□□□□□ -0.592e-11■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-211ENST00000520150 1054 ntTSL 211.29□□□□□ -0.69e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ABCA2-218ENST00000487109 8031 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.622e-11■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.622e-11■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DBF4B-205ENST00000526924 2998 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.669e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SIL1-204ENST00000503732 690 ntTSL 310.95□□□□□ -0.669e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SPECC1-207ENST00000413167 574 ntTSL 310.9□□□□□ -0.669e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ABCA2-208ENST00000459850 8073 ntTSL 1 (best)10.78□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NCALD-202ENST00000311028 3655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ZNF292-207ENST00000496806 770 ntTSL 310.69□□□□□ -0.71e-9■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NRF1-205ENST00000393232 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.729e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.749e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RPRD1A-206ENST00000588459 576 ntTSL 410.38□□□□□ -0.759e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NRF1-206ENST00000454688 814 ntTSL 510.3□□□□□ -0.769e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GPATCH2L-204ENST00000554125 6248 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 CDC42EP4-207ENST00000581045 539 ntTSL 410.28□□□□□ -0.769e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 TCF4-204ENST00000457482 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.799e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.817e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 FAXDC2-214ENST00000523997 530 ntTSL 49.99□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SPECC1-205ENST00000395529 4971 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.819e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 ATG7-215ENST00000451830 549 ntTSL 49.85□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NRF1-204ENST00000393230 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-222ENST00000523737 559 ntTSL 49.76□□□□□ -0.859e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.859e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 LINC01135-201ENST00000419531 996 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.859e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 IL18RAP-201ENST00000264260 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SH3BP5L-204ENST00000494837 658 ntTSL 29.68□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NCALD-220ENST00000522078 540 ntTSL 49.67□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NRF1-203ENST00000353868 3568 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DBF4B-204ENST00000526915 562 ntTSL 39.63□□□□□ -0.879e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SYT5-210ENST00000592935 611 ntTSL 39.5□□□□□ -0.891e-12■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NCALD-230ENST00000524209 553 ntTSL 49.42□□□□□ -0.93e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 AC007389.1-201ENST00000606978 1117 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.932e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 FAXDC2-205ENST00000517938 1203 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DBF4B-201ENST00000315005 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.979e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SPECC1-201ENST00000261503 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.979e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 AC007389.1-202ENST00000377977 1266 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.992e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -19e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SLC39A9-203ENST00000538956 1264 ntTSL 28.75□□□□□ -1.017e-15■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SLC39A9-210ENST00000557046 855 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.017e-15■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-208ENST00000519213 579 ntTSL 48.69□□□□□ -1.029e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 FAXDC2-201ENST00000326080 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.033e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-204ENST00000518219 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.039e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 SIL1-208ENST00000505945 250 ntTSL 1 (best)8.47□□□□□ -1.059e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-223ENST00000523835 503 ntTSL 58.46□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-203ENST00000517338 548 ntTSL 48.46□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MKL1-206ENST00000422851 569 ntTSL 58.06□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NCALD-206ENST00000517822 583 ntTSL 48.05□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 TCF4-273ENST00000630720 1552 ntTSL 58.04□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 DBF4B-208ENST00000528766 836 ntTSL 27.83□□□□□ -1.169e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-214ENST00000520995 535 ntTSL 57.83□□□□□ -1.169e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-224ENST00000524068 556 ntTSL 47.82□□□□□ -1.169e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-209ENST00000519318 848 ntTSL 27.76□□□□□ -1.179e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 TCF4-246ENST00000570287 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.229e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 NCALD-215ENST00000520690 548 ntTSL 47.42□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 FAXDC2-202ENST00000423554 3817 ntTSL 27.29□□□□□ -1.243e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 GPATCH2L-206ENST00000554799 821 ntTSL 57.18□□□□□ -1.264e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 FAXDC2-216ENST00000524363 584 ntTSL 37.12□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 TCF4-219ENST00000563760 856 ntTSL 57.08□□□□□ -1.289e-7■■■■■ 27.6
PTBP1P26599 MRNIP-218ENST00000522157 541 ntTSL 47.08□□□□□ -1.289e-7■■■■■ 27.6
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 502.5 ms