RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592935.1

SYT5-210, Transcript of synaptotagmin 5, humanhuman

TSL 3

Gene SYT5, Length 611 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5-210ENST00000592935 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.27■■■□□ 2.6
SYT5-210ENST00000592935 ABCC9O60706 1549 aa28.21■■■□□ 2.11
SYT5-210ENST00000592935 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.96■■■□□ 2.07
SYT5-210ENST00000592935 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.71■■□□□ 1.87
SYT5-210ENST00000592935 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.63■■□□□ 1.85
SYT5-210ENST00000592935 NACADO15069 1562 aa26.52■■□□□ 1.84
SYT5-210ENST00000592935 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.52■■□□□ 1.84
SYT5-210ENST00000592935 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
SYT5-210ENST00000592935 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.12■■□□□ 1.77
SYT5-210ENST00000592935 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.05■■□□□ 1.76
SYT5-210ENST00000592935 BICRAQ9NZM4 1560 aa26■■□□□ 1.75
SYT5-210ENST00000592935 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SYT5-210ENST00000592935 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.78■■□□□ 1.72
SYT5-210ENST00000592935 SCRIBQ14160 1630 aa25.59■■□□□ 1.69
SYT5-210ENST00000592935 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.55■■□□□ 1.68
SYT5-210ENST00000592935 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.41■■□□□ 1.66
SYT5-210ENST00000592935 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.4■■□□□ 1.66
SYT5-210ENST00000592935 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SYT5-210ENST00000592935 NCAPD3P42695 1498 aa24.55■■□□□ 1.52
SYT5-210ENST00000592935 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.47■■□□□ 1.51
SYT5-210ENST00000592935 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.43■■□□□ 1.5
SYT5-210ENST00000592935 SMARCA4P51532 1647 aa24.37■■□□□ 1.49
SYT5-210ENST00000592935 SMARCA2P51531 1590 aa24.33■■□□□ 1.48
SYT5-210ENST00000592935 ERCC6Q03468 1493 aa24.32■■□□□ 1.48
SYT5-210ENST00000592935 HMGXB3Q12766 1538 aa24.3■■□□□ 1.48
SYT5-210ENST00000592935 CUX2O14529 1486 aa24.27■■□□□ 1.48
SYT5-210ENST00000592935 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SYT5-210ENST00000592935 NESP48681 1621 aa24.23■■□□□ 1.47
SYT5-210ENST00000592935 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SYT5-210ENST00000592935 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.13■■□□□ 1.45
SYT5-210ENST00000592935 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.12■■□□□ 1.45
SYT5-210ENST00000592935 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.93■■□□□ 1.42
SYT5-210ENST00000592935 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SYT5-210ENST00000592935 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.84■■□□□ 1.41
SYT5-210ENST00000592935 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.81■■□□□ 1.4
SYT5-210ENST00000592935 WIZO95785 1651 aa23.79■■□□□ 1.4
SYT5-210ENST00000592935 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.79■■□□□ 1.4
SYT5-210ENST00000592935 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SYT5-210ENST00000592935 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.65■■□□□ 1.38
SYT5-210ENST00000592935 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SYT5-210ENST00000592935 WDR62O43379 1518 aa23.59■■□□□ 1.37
SYT5-210ENST00000592935 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.53■■□□□ 1.36
SYT5-210ENST00000592935 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.53■■□□□ 1.36
SYT5-210ENST00000592935 CFTRP13569 1480 aa23.51■■□□□ 1.35
SYT5-210ENST00000592935 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SYT5-210ENST00000592935 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SYT5-210ENST00000592935 TRIM41Q8WV44 630 aa23.35■■□□□ 1.33
SYT5-210ENST00000592935 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.27■■□□□ 1.32
SYT5-210ENST00000592935 OSCARQ8IYS5 282 aa23.22■■□□□ 1.31
SYT5-210ENST00000592935 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.18■■□□□ 1.3
SYT5-210ENST00000592935 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SYT5-210ENST00000592935 PRDM2Q13029 1718 aa23.08■■□□□ 1.28
SYT5-210ENST00000592935 IFT140Q96RY7 1462 aa23.07■■□□□ 1.28
SYT5-210ENST00000592935 TOPBP1Q92547 1522 aa23.07■■□□□ 1.28
SYT5-210ENST00000592935 ABCC8Q09428 1581 aa22.95■■□□□ 1.26
SYT5-210ENST00000592935 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.93■■□□□ 1.26
SYT5-210ENST00000592935 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
SYT5-210ENST00000592935 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SYT5-210ENST00000592935 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.86■■□□□ 1.25
SYT5-210ENST00000592935 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.86■■□□□ 1.25
SYT5-210ENST00000592935 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.86■■□□□ 1.25
SYT5-210ENST00000592935 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SYT5-210ENST00000592935 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SYT5-210ENST00000592935 ARHGEF11O15085 1522 aa22.82■■□□□ 1.24
SYT5-210ENST00000592935 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.8■■□□□ 1.24
SYT5-210ENST00000592935 FBLN2P98095 1184 aa22.76■■□□□ 1.23
SYT5-210ENST00000592935 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SYT5-210ENST00000592935 SOGA1O94964 1423 aa22.75■■□□□ 1.23
SYT5-210ENST00000592935 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.72■■□□□ 1.23
SYT5-210ENST00000592935 CHD1O14646 1710 aa22.68■■□□□ 1.22
SYT5-210ENST00000592935 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.68■■□□□ 1.22
SYT5-210ENST00000592935 CUX1P39880 1505 aa22.66■■□□□ 1.22
SYT5-210ENST00000592935 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT5-210ENST00000592935 ARAP1Q96P48 1450 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT5-210ENST00000592935 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SYT5-210ENST00000592935 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SYT5-210ENST00000592935 GRIN2BQ13224 1484 aa22.53■■□□□ 1.2
SYT5-210ENST00000592935 WDR97A6NE52 1622 aa22.52■■□□□ 1.2
SYT5-210ENST00000592935 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SYT5-210ENST00000592935 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.49■■□□□ 1.19
SYT5-210ENST00000592935 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SYT5-210ENST00000592935 SYNJ2O15056 1496 aa22.46■■□□□ 1.19
SYT5-210ENST00000592935 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.45■■□□□ 1.18
SYT5-210ENST00000592935 SYNJ1O43426 1573 aa22.43■■□□□ 1.18
SYT5-210ENST00000592935 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.4■■□□□ 1.18
SYT5-210ENST00000592935 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.35■■□□□ 1.17
SYT5-210ENST00000592935 PBRM1Q86U86 1689 aa22.34■■□□□ 1.17
SYT5-210ENST00000592935 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
SYT5-210ENST00000592935 GRIN2AQ12879 1464 aa22.24■■□□□ 1.15
SYT5-210ENST00000592935 TOP2BQ02880 1626 aa22.22■■□□□ 1.15
SYT5-210ENST00000592935 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT5-210ENST00000592935 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.2■■□□□ 1.14
SYT5-210ENST00000592935 ADAMTS12P58397 1594 aa22.19■■□□□ 1.14
SYT5-210ENST00000592935 NUP160Q12769 1436 aa22.18■■□□□ 1.14
SYT5-210ENST00000592935 CEP170Q5SW79 1584 aa22.17■■□□□ 1.14
SYT5-210ENST00000592935 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.16■■□□□ 1.14
SYT5-210ENST00000592935 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT5-210ENST00000592935 SHROOM2Q13796 1616 aa22.03■■□□□ 1.12
SYT5-210ENST00000592935 JPH4Q96JJ6 628 aa22■■□□□ 1.11
SYT5-210ENST00000592935 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms