Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COPG2Q9UBF2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms