Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HINFPQ9BQA5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HINFPQ9BQA5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms