Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC34Q96HJ3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC34Q96HJ3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms